Förutom de två Hammarby-lagen spelade också 26 andra lag i Pojkar 16 (född 2001). De var uppdelade i 7 olika grupper, varav Hammarby IF FF 3 började i Grupp 4 tillsammans med Bele Barkarby FF 1, Tyresö FF 4 och Konyaspor Kultur och IF 1.

Hammarby IF FF 3 tog sig vidare till Cupspel efter att ha hamnat på 2:a plats i Grupp 4. Väl där säkrade de en förstaplats i slutspelet efter att ha slagit Enskede IK med 2-0 i finalen. Hammarby IF FF 3 vann alltså Cupspel i Pojkar 16 (född 2001) under ST-Cupen 2016.